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Ressource documentaire

Sarcoma Database: a unique tool for research on mesenchymal tumors (en Anglais)


URL d'accès : http://www.canal-u.tv/?redirectVideo=19662...

Droits : Creative Commons (BY NC)

Auteur(s) : COINDRE Jean-Michel, Université de Bordeaux - Service Audiovisuel et Multimédia
Éditeur(s) : Université de Bordeaux - Service Audiovisuel et Multimédia
10-11-2015

Description : Clinical biology session The main sarcoma databases are the Conticabase (https://conticabase.sarcomabcb.org) and the ConticaGist (https://conticagist.sarcomabcb.org) with 18000 patients and which collect data describing patient, primary tumor, histology, molecular biology, treatment and follow-up as well as the material stored (paraffin blocks, frozen tissue, peripheral blood and cell lines). With the organization of national networks, data on practices regarding histological diagnosis and clinical management are collected in specific databases (https://rreps.sarcomabcb.org and https://netsarc.sarcomabcb.org). Currently, this database contents data from 45000 patients and will be soon merge with the Conticabase and ConticaGist. These databases allow studies on medical practices, medico-economical studies, description of large cohorts, pathological and molecular studies, such as histological and molecular grading, and basic research studies such as the full genome sequencing in leiomyosarcomas in the context of the ICGC programme. We now have the project to integrate heterogeneous data, such as genomic, expression profiling and NGS data with the phenotypic data of the sarcomaBCB in the open source platforms I2B2 and Transmart in order to make available to the clinicians a tool for the best selection of targeted treatment for homogeneous groups of patients and to the researchers a tool for their research projects. Cette présentation a été donnée dans le cadre du BRIO SIRIC scientific day 3 organisé annuellement par le SIRIC BRIO et qui a pour but de réunir tous les acteurs du SIRIC BRIO et plus largement de la cancérologie à Bordeaux.
Mots-clés libres : cancer,Oncologie,Thérapie,Recherche
TECHNIQUE

Type : image en mouvement
Format : video/x-flv


Source(s) : 
rtmpt://fms2.cerimes.fr:80/vod/groupe_dcam/sarcoma.database.a.unique.tool.for.research.on.mesenchymal.tumors_19662/brio.siric.2015_jean.michel.coindre_mdeb.mp4


Entrepôt d'origine : Canal-u.fr
Identifiant : oai:canal-u.fr:19662
Type de ressource : Ressource documentaire
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Ressource pédagogique

Sarcoma Database: a unique tool for research on mesenchymal tumors (en Anglais)


URL d'accès : http://www.canal-u.tv/video/universite_bordeaux_se...
rtmpt://fms2.cerimes.fr:80/vod/groupe_dcam/sarcoma...

Identifiant de la fiche : 19662
Schéma de la métadonnée : LOMv1.0, LOMFRv1.0

Droits : libre de droits, gratuit
Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Creative Commons (BY NC)

Auteur(s) : COINDRE JEAN-MICHEL
Éditeur(s) : Université de Bordeaux - Service Audiovisuel et Multimédia, Université de Bordeaux - Service Audiovisuel et Multimédia, Université de Bordeaux - Service Audiovisuel et Multimédia
10-11-2015

Description : Clinical biology session The main sarcoma databases are the Conticabase (https://conticabase.sarcomabcb.org) and the ConticaGist (https://conticagist.sarcomabcb.org) with 18000 patients and which collect data describing patient, primary tumor, histology, molecular biology, treatment and follow-up as well as the material stored (paraffin blocks, frozen tissue, peripheral blood and cell lines). With the organization of national networks, data on practices regarding histological diagnosis and clinical management are collected in specific databases (https://rreps.sarcomabcb.org and https://netsarc.sarcomabcb.org). Currently, this database contents data from 45000 patients and will be soon merge with the Conticabase and ConticaGist. These databases allow studies on medical practices, medico-economical studies, description of large cohorts, pathological and molecular studies, such as histological and molecular grading, and basic research studies such as the full genome sequencing in leiomyosarcomas in the context of the ICGC programme. We now have the project to integrate heterogeneous data, such as genomic, expression profiling and NGS data with the phenotypic data of the sarcomaBCB in the open source platforms I2B2 and Transmart in order to make available to the clinicians a tool for the best selection of targeted treatment for homogeneous groups of patients and to the researchers a tool for their research projects. Cette présentation a été donnée dans le cadre du BRIO SIRIC scientific day 3 organisé annuellement par le SIRIC BRIO et qui a pour but de réunir tous les acteurs du SIRIC BRIO et plus largement de la cancérologie à Bordeaux.
Mots-clés libres : cancer, oncologie, thérapie, recherche

Classification UNIT : Sciences du vivant > Santé et médical
Classification : Technologie (Sciences appliquées) > Sciences médicales, Médecine
Indice(s) Dewey: Cancer (616.994)


PEDAGOGIQUE

Type pédagogique : cours / présentation

Niveau : doctorat, enseignement supérieur



TECHNIQUE


Type de contenu : image en mouvement
Format : video/x-flv
Taille : 101.47 Mo
Durée d'exécution : 17 minutes 11 secondes



RELATIONS


Cette ressource fait partie de :
  • BRIO SIRIC scientific day 3



Entrepôt d'origine : Canal-u.fr
Identifiant : oai:canal-u.fr:19662
Type de ressource : Ressource pédagogique
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