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Ressource documentaire

EMOIS Nancy 2011 - Développement et évaluation d'un algorithme de notification (en Français)


URL d'accès : http://www.canal-u.tv/canalu/producteurs/canal_u_m...

Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs

Auteur(s) : JOUHET Vianney, Canal-U/Sciences de la Santé et du Sport , CERIMES
18-03-2011

Description : Titre : Développement et évaluation d'un algorithme de notification des cas incidents de cancer au sein d'un système d'information régional.Résumé : Le registre général des cancers de Poitou-Charentes a développé un système d’information multi-sources rapprochant les informations codées du PMSI, des laboratoires d’anatomie pathologique et de l’Assurance Maladie. Une réflexion a été menée sur une méthode de sélection des enregistrements qualifiants pour la notification des tumeurs en privilégiant le codage du clinicien pour la topographie et le codage de l’anatomopathologiste pour la morphologie. Nous proposons de comparer cette approche avec une méthode utilisant la totalité des enregistrements à l’aide de mesures objectives.Méthodes: L’algorithme sélectionne de façon hiérarchique les enregistrements selon leurs typologies (type de source, acte CCAM de prélèvement ou de chirurgie au sein du RUM) pour cibler le praticien producteur. L’évaluation a été réalisée en calculant le rappel (sensibilité), la précision (valeur prédictive positive) et la F-Mesure (composite du rappel et de la précision) à partir de la comparaison des tumeurs notifiées automatiquement et des tumeurs validées par les médecins du registre.Résultats: L’évaluation a été réalisée à partir de 6145 dossiers validés qui correspondaient à 6327 tumeurs. On note une amélioration nette des performances avec l’approche sélective avec une F-Mesure de 0,81 contre 0,74. L’amélioration se fait surtout par un gain de précision et une augmentation moindre du rappel.Conclusion: Nous avons montré l’intérêt de ne pas utiliser l’ensemble de l’information pour la notification. Notre approche présente un net gain de précision montrant que nous avons surtout éliminé le bruit lié au codage imprécis ou erroné. L’approche hiérarchisée permet de ne pas altérer le rappel en adaptant les choix effectués à la complétude du dossier.L’amélioration des performances permet de favoriser une préparation rigoureuse du dossier pour faciliter la validation manuelle par un opérateur. Cette étape de validation reste cependant essentielle pour rattraper les erreurs et les absences de notification identifiées.Intervenant : JOUHET Vianney (Unité d’épidémiologie, de Biostatistique et registre des cancers de Poitou-Charentes, Faculté de médecine, Centre Hospitalier Universitaire de Poitiers, Université de Poitiers, 6).Conférence enregistrée lors des journées EMOIS 2011 à Nancy. Session : PMSI et épidémiologie II. Modérateurs Eliane ALBUISSON (CHU de Nancy) et Gilles CHATELIER (Association Robert Debré – Paris).Réalisation, production : Canalu U/3S, CERIMES.SCD Médecine.
Mots-clés libres : algorithme, codage, EMOIS Nancy 2011, notification, PMSI, registre des cancers, RUM, système d’information
TECHNIQUE

Type : image en mouvement
Format : video/x-flv


Source(s) : 
rtmp://streamer2.cerimes.fr/vod/canalu/videos/cutms/emois2011_d1_jouhet_sd.mp4


Entrepôt d'origine : Canal-U - OAI Archive
Identifiant : oai:canal-u.fr:222066
Type de ressource : Ressource documentaire
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Ressource pédagogique

EMOIS Nancy 2011 - Développement et évaluation d'un algorithme de notification  (en Français)


URL d'accès : http://www.canal-u.tv/canalu/producteurs/canal_u_m...
rtmp://streamer2.cerimes.fr/vod/canalu/videos/cutm...

Identifiant de la fiche : 222066
Schéma de la métadonnée : LOMv1.0, LOMFRv1.0

Droits : libre de droits, gratuit
Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs

Auteur(s) : JOUHET VIANNEY
Éditeur(s) : Canal-U/Sciences de la Santé et du Sport, CERIMES
18-03-2011

Description :  Titre : Développement et évaluation d'un algorithme de notification des cas incidents de cancer au sein d'un système d'information régional.Résumé : Le registre général des cancers de Poitou-Charentes a développé un système d’information multi-sources rapprochant les informations codées du PMSI, des laboratoires d’anatomie pathologique et de l’Assurance Maladie. Une réflexion a été menée sur une méthode de sélection des enregistrements qualifiants pour la notification des tumeurs en privilégiant le codage du clinicien pour la topographie et le codage de l’anatomopathologiste pour la morphologie. Nous proposons de comparer cette approche avec une méthode utilisant la totalité des enregistrements à l’aide de mesures objectives.Méthodes: L’algorithme sélectionne de façon hiérarchique les enregistrements selon leurs typologies (type de source, acte CCAM de prélèvement ou de chirurgie au sein du RUM) pour cibler le praticien producteur. L’évaluation a été réalisée en calculant le rappel (sensibilité), la précision (valeur prédictive positive) et la F-Mesure (composite du rappel et de la précision) à partir de la comparaison des tumeurs notifiées automatiquement et des tumeurs validées par les médecins du registre.Résultats: L’évaluation a été réalisée à partir de 6145 dossiers validés qui correspondaient à 6327 tumeurs. On note une amélioration nette des performances avec l’approche sélective avec une F-Mesure de 0,81 contre 0,74. L’amélioration se fait surtout par un gain de précision et une augmentation moindre du rappel.Conclusion: Nous avons montré l’intérêt de ne pas utiliser l’ensemble de l’information pour la notification. Notre approche présente un net gain de précision montrant que nous avons surtout éliminé le bruit lié au codage imprécis ou erroné. L’approche hiérarchisée permet de ne pas altérer le rappel en adaptant les choix effectués à la complétude du dossier.L’amélioration des performances permet de favoriser une préparation rigoureuse du dossier pour faciliter la validation manuelle par un opérateur. Cette étape de validation reste cependant essentielle pour rattraper les erreurs et les absences de notification identifiées.Intervenant : JOUHET Vianney (Unité d’épidémiologie, de Biostatistique et registre des cancers de Poitou-Charentes, Faculté de médecine, Centre Hospitalier Universitaire de Poitiers, Université de Poitiers, 6).Conférence enregistrée lors des journées EMOIS 2011 à Nancy. Session : PMSI et épidémiologie II. Modérateurs Eliane ALBUISSON (CHU de Nancy) et Gilles CHATELIER (Association Robert Debré – Paris).Réalisation, production : Canalu U/3S, CERIMES.SCD Médecine.
Mots-clés libres : algorithme, codage, Emois Nancy 2011, notification, PMSI, registre des cancers, RUM,  système d’information

Classification UNIT : Matériaux > Autres
Sciences du vivant > Santé et médical
Classification : Technologie (Sciences appliquées) > Sciences médicales, Médecine
Sciences sociales > Statistiques générales
Instruments du savoir : organisations et documents > Informatique
Indice(s) Dewey: Sciences médicales. Médecine (610)
Statistiques (310)
Traitement des données. Informatique (004)


PEDAGOGIQUE

Type pédagogique : cours / présentation

Niveau : enseignement supérieur, doctorat, bac>=6, formation continue, autres, autres



TECHNIQUE


Type de contenu : image en mouvement
Format : video/x-flv
Taille : 57.09 Mo
Durée d'exécution : 14 minutes 16 secondes



RELATIONS


Cette ressource fait partie de :
  • EMOIS Nancy 2011



Entrepôt d'origine : Canal-U - OAI Archive
Identifiant : oai:canal-u.fr:222066
Type de ressource : Ressource pédagogique
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