Etude comparée des différents organites d'une cellule par microscopie optique en contraste de phase et par microscopie électronique. Mise en évidence d'organites à peine soupçonnés ou même inconnus. Extension à l'étude des cellules cancéreuses. Bibliographie : La cellule, dictionnaire encyclopédique sous la direction de Nicole Aimé-Genty, Editions VuibertGénériqueAuteur-réalisateur : Marcel BESSIS Producteur : Laboratoires MIDY Diffuseur : Institut de cinématographie scientifique (e-mail : ics@cnrs-bellevue.fr)
Mot(s) clés libre(s) : biologie cellulaire, cellule, cytoplasme, enzyme, microscopie, noyau, nucléole, organite, structure cellulaire

Les expériences de cinétique et de liaison à l’équilibre sont incontournables pour étudier les réactions biologiques. Ce cours aborde le formalisme de la cinétique formelle et enzymatique ainsi que les liaisons (sites indépendants et allostérie), donc toutes les notions de bases nécessaires à l’interprétation des réactions biologiques.
Mot(s) clés libre(s) : formalisme, cinétique, enzyme, enzymologie, Michaëlis, état quasi-stationnaire, pré équilibre rapide, effecteur, activateur, inhibiteur, liaison, coopérativité, allostérie

De la chimie de synthèse à la biologie de synthèseFrom Synthetic Chemistry to Synthetic BiologyConférence internationalemardi 5 mai 2009amphithéâtre Maurice HalbwachsCollège de France11 place Marcelin-Berthelot - 75005 Paris9h40 Marc FONTECAVE (Collège de France)Entre biologie et chimie: catalyse et synthèsebio-inspirées
Mot(s) clés libre(s) : bio-technologies, biologie synthétique, catalyse, chimie bio-inspirée, chimie de synthèse, chimie verte, économie hydrogène, enzyme

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Mot(s) clés libre(s) : ADN, biologie moléculaire, chimie des gènes, chromosome, enzyme, information génétique, métabolisme, nucléotide, séquençage du génome, structure chimique

Nous proposons de porter un regard de chimiste sur la catalyse enzymatique. Un bref panorama permet de réaliser que les enzymes sont omniprésentes dans les réactions du vivant, les accélérant avec spécificité et efficacité. À travers une perspective historique, nous passerons en revue les différentes explications avancées pour expliquer ces facultés, en tentant de dégager une compréhension moléculaire de la catalyse enzymatique.
Mot(s) clés libre(s) : enzyme, catalyse, Biochimie

Le Docteur Patrick Lacolley intervient sur le thème suivant : la rigidité artérielle, un facteur de risque cardiovasculaire. Il y a différentes façons de mesurer la rigidité artérielle et deux facteurs déterminants : l'âge, et la pression artérielle. Le premier paramètre à analyser est le rapport élastine collagène. L'intégrine est primordiale dans le remodelage de la paroi artérielle. Origine 10ème colloque de biologie prospective InterReg III A. Canal-U Médecine - 2006 Générique Réalisation : CERIMES - SPI-EAO SCD medecine
Mot(s) clés libre(s) : arterial stiffness-extracellular, biologie prospective, enzyme, intégrines, paroi artérielle, rigidité artérielle, risque cardiovasculaire

Ce TP propose l'étude des enzymes en tant que catalyseur, par comparaison avec une catalyse chimique.
Mot(s) clés libre(s) : enzyme, Biochimie

Il y a plus de cent ans, les chimistes ont commencé à exploiter des modèles pour visualiser les molécules qu'ils manipulaient dans leurs tubes à essais. Les modèles physiques permettent de mieux comprendre la forme et la flexibilité des molécules, mais ils sont longs à construire, souvent chers, et ils ne donnent qu'une vue très approximative des molécules. De surcroît, ils sont peu adaptés à la représentation des grandes molécules qui caractérisent la vie et qui contiennent des milliers, voire des centaines de milliers, d'atomes. Depuis environ quarante ans, les ordinateurs offrent une alternative aux modèles physiques. Ils permettent de décrire les molécules (et les macromolécules) d'une façon beaucoup plus réaliste en tenant compte de l'ensemble des interactions qui peuvent avoir lieu entre ces espèces. Ils permettent non seulement de visualiser les molécules, mais aussi d'étudier leur dynamique et leurs interactions. La modélisation ne remplace pas l'expérimentation, mais elle aide à analyser des résultats et surtout à formuler de nouvelles hypothèses. J'illustrerai ces développements avec des exemples portant sur les acides nucléiques, et, en particulier, la double hélice d'ADN, sur les protéines et sur les complexes formés entre ces macromolécules. Je montrerai comment on peut approcher les molécules avec l'oeil de l'ingénieur civil, et comment les molécules sondent leurs propres propriétés mécaniques pour se reconnaître. Je parlerai aussi de la modélisation au service des physiciens qui ont appris à manipuler les molécules une à une, ou au service du biologiste "seigneur des anneaux". Je terminerai en parlant de l'avenir de la modélisation: est-ce que nous pouvons commencer déjà à simuler non seulement une ou deux molécules, mais plutôt les systèmes moléculaires organisés qui animent nos cellules ?
Mot(s) clés libre(s) : ADN, enzyme, macromolécule biologique, modèle moléculaire, modélisation, protéine, simulation informatique, structure chimique, système vivant

La plupart des réactions biologiques qui forment le corps humain sont des réactions catalytiques. La catalyse joue un rôle également déterminant dans des processus industriels majeurs comme la synthèse de l'ammoniac, le raffinage du pétrole ou la réduction des oxydes d'azote dans les pots catalytiques. Un catalyseur est un composé qui rend possible une réaction chimique mais qui sort indemne de la transformation. Un catalyseur peut agir sur un acte élémentaire ou sur le bilan d'une réaction complexe ; enfin il peut orienter vers une réaction plutôt qu'une autre. La catalyse concerne tous les domaines de la chimie. La catalyse acido-basique concerne le domaine de la chimie organique. Les catalyseurs dans le domaine de la biochimie sont les enzymes qui doivent épouser une forme complémentaire du substrat pour s'adapter à lui, puis présenter un site actif où la réactivité est modifiée. La catalyse homogène est le domaine de la chimie organométallique ; elle concerne un centre métallique dont l'environnement électronique et géométrique est bien défini, ce qui permet de bien contrôler la réaction. La catalyse hétérogène concerne la science des surfaces et des interfaces. Du point de vue industriel, ces catalyseurs sont les plus employés car ils présentent de nombreux sites actifs qui sont utilisés de nombreuses fois de façon consécutive. Comprendre un processus catalytique, c'est aller au delà d'un simple bilan, cela nécessite de décrire les étapes du voyage partant des réactifs et allant vers les produits. Comprendre la catalyse, c'est décrire la réaction dans son environnement. Cela devrait être de plus en plus le cas durant le prochain siècle et cela devrait permettre d'améliorer les performances des catalyseurs déjà connus.
Mot(s) clés libre(s) : adsorption, biochimie, catalyse, chimie industrielle, chimie organique, cinétique, enzyme, enzymologie, inhibiteur, réaction chimique, thermodynamique, turn-over

La construction des protéines recombinantes (PR) se fait en intégrant des fragments d'ADN (ADNc) dans le génome d'organismes vivants. On obtient ainsi en quantité suffisante des protéines clefs autrement impossibles à purifier du fait de leur rareté. L'ADNc est choisi pour coder des molécules utiles à la compréhension, à la détection et au traitement des maladies. Les manipulations de l'ADNc, telle la mutagenèse dirigée, permettent d'établir les relations de leur fonction avec leur structure tridimensionnelle (3D). Les concepts et le savoir-faire nécessaires à la sélection et à leur construction du recombinant sont désormais incontournables pour les programmes de recherche de "l'après génome" comme pour les programmes de types industriels. Dans son émission 1, François Godeau nous explique le principe d'obtention des PR et nous donne des exemples de leur applications. Dans son émission 2, il nous expose comment on élabore un projet d'utilisation des protéines recombinantes pour la détection précoce des cancers.
Mot(s) clés libre(s) : ADN, ARN, canc, cellules dendritiques, Code génétique, enzymes de restriction, génétique moléculaire, hépatite, insectes, northern blot, réaction de polymérisation en chaîne (PCR), sondes d1hybridation, transcriptase inverse, vecteurs, virus, western blot