Algues marines, génomes et biotechnologies par Bernard Kloareg. Principaux producteurs primaires en milieu océanique, les algues marines constituent une variété de lignées végétales qui se sont individualisées très tôt au cours de l’évolution des eucaryotes : les algues rouges, apparues il y a environ 1600 millions d’années, sont les végétaux les plus anciens sur la Terre ; les algues vertes, qui en dérivent directement, ont ensuite conquis les milieux émergés pour donner naissance aux plantes terrestres ; les algues brunes résultent d’une symbiose un peu plus récente, entre un protiste et une algue rouge unicellulaire. C’est cette très longue histoire évolutive qui, en premier lieu, motive notre intérêt pour la génomique des algues marines. Avec l’aide du Centre National de Séquençage, nous avons donc entrepris la description des génomes complets d’ Ectocarpus siliculosus, une algue brune, et de Chondrus crispus, une algue rouge. Un premier enjeu de ces recherches est, par comparaison avec les génomes déjà connus chez les plantes et chez les animaux, de retracer l’évolution de ces génomes à partir de leur ancêtre commun. Il apparait que certaines caractéristiques considérées jusqu’alors comme typiquement « animales » sont ancestrales, tandis que d’autres qualifiées de « végétales » (au sens des plantes terrestres) sont, en fait, dérivées. Nous espérons également mieux comprendre comment est apparue chez les diverses lignées eucaryotes la capacité à s’organiser en organismes pluricellulaires. De plus, ces végétaux font l’objet d’importantes récoltes en Europe et en Amérique ainsi que d’une aquaculture intensive en Asie. En effet, les algues marines renferment des composés naturels d’intérêt, qu’ils soient de nature polysaccharidique, lipidique ou encore minérale. Ainsi, les algues marines ont développé des métabolites de défense originaux, en tirant profit de l’abondance de certains composés halogénés dans l’eau de mer. Nous discuterons les perspectives désormais ouvertes dans le domaine des biotechnologies marines par les données émergentes en génomique sur ces végétaux et sur les bactéries qui leurs sont associées.
Mot(s) clés libre(s) : ADN, algue, génome, mer

Grâce aux techniques de séquençage de l’ADN, nous avons aujourd’hui les moyens technologiques de connaitre le génome des organismes vivants, le plancton des océans y compris. Mais est-ce si simple ? Comment extraire de l’information biologique de gigantesques masses de données contenant des fragments des génomes des organismes vivants dans les océans ? Comment développer un outil informatique pertinent mais assez simple et rapide pour venir à bout de plusieurs téraoctets de données brutes ? Faisons le point sur un projet algorithmique qui a vu le jour grâce aux données générées par l’expédition Tara Ocean.
Mot(s) clés libre(s) : séquençage ADN, bioinformatique, extraction information, génome, algorithme

Organisés par les universités de Lorraine en collaboration avec l’INSERM, le CNRS, l’INRIA et l’INRARésumé : De l'utilisation des cellules souches au contrôle génétique de l'immigration, jusqu'où peut-on aller ? Accroître la connaissance scientifique, mais à quel prix ? Un débat qui dépasse largement la science. Intervenants : Duplessis Sébastien, Py Bruno, Jonveaux Philippe.SCD Médecine.
Mot(s) clés libre(s) : acide aminé, ADN, biologie moléculaire, Cafés des Sciences Nancy Université, cellule souche, codon, filiation, génome, protéine

Il n'y a, en vérité, pas de réponse à cette question. Il n'y en a pas une mais plusieurs, la réalité est complexe et multiforme. Lorsque l'on parle d'évolution, l'opinion générale est que les espèces se sont succédées à la surface de la Terre, que les dinosaures ont laissé la place aux mammifères, et que certains primates sont devenus des bipèdes plus ou moins bien pensant. Tout cela fait parti d'un fond commun appris à l'école. Mais les choses deviennent beaucoup moins évidentes lorsque l'on aborde la question du temps, à quelle vitesse ces phénomènes se produisent-ils, à quelle vitesse les espèces nouvelles apparaissent-elles. Cela reste une énigme. Pour répondre à cette question, il faut avoir une bonne définition de l'espèce. La disparition d'une espèce semble assez facilement envisageable, mais l'apparition, la création ou la re-création d'une catégorie de biodiversité équivalente, est plus difficile à déterminer. La réalité est la résultante de nombreux paramètres, souvent complexes.
Mot(s) clés libre(s) : adaptation, anagénèse, cladogenèse, espèce vivante, évolution, extinction d’espèces, génétique, génome, phénotype, sélection naturelle, sélection sexuelle, spéciation, théorie de l'évolution

Actuellement de nombreux projets de séquençage de génomes sont en cours de réalisation ou même achevés (de nombreux microorganismes, bactéries et virus ; la levure de boulangerie Saccharomyces cerevisiae ; Caenorhabditis elegans ;Homo sapiens).Comment ces connaissances ont-elles pu être acquises dans un délai relativement court (le projet génome humain a été lancé en 1987) ? Quelles techniques ont été réalisées ? Qu'ont apporté ces résultats ? Quelles interrogations subsistent ?Ces différents points seront abordés dans le développement de ce cours. Mais avant de les aborder il est nécessaire de faire un bref retour sur les fonctions essentielles qui caractérisent le monde vivant.
Mot(s) clés libre(s) : génétique, génome, biodiversité, Génétique

De la chimie de synthèse à la biologie de synthèseFrom Synthetic Chemistry to Synthetic BiologyConférence internationalemardi 5 mai 2009amphithéâtre Maurice HalbwachsCollège de France11 place Marcelin-Berthelot - 75005 Paris15h50 Maureen O’MALLEY (Egenis, University of Exeter)Epistemological Distinctions in SyntheticBiology
Mot(s) clés libre(s) : biologie synthétique, biologie systémique, chimie de synthèse, épistémologie, génie génétique, génome, ingénierie de la biologie

De la chimie de synthèse à la biologie de synthèseFrom Synthetic Chemistry to Synthetic BiologyConférence internationalemardi 5 mai 2009amphithéâtre Maurice HalbwachsCollège de France11 place Marcelin-Berthelot - 75005 Paris11h30 Antoine DANCHIN (Institut Pasteur)Les gènes du démon de Maxwell : est-ilpossible de construire une usine cellulaire ?
Mot(s) clés libre(s) : biologie synthétique, chimie de synthèse, génie génétique, génome, information, organisme vivant, réplication, système biologique

De la chimie de synthèse à la biologie de synthèseFrom Synthetic Chemistry to Synthetic BiologyConférence internationalemardi 5 mai 2009amphithéâtre Maurice HalbwachsCollège de France11 place Marcelin-Berthelot - 75005 Paris14h30 Bernard MEUNIER (PALUMED)Molécules hybrides : stratégie pour laconception de nouveaux médicamentsanti-infectieux
Mot(s) clés libre(s) : ADN, antibiotique, bactérie, biologie synthétique, biotechnologies, chimie de synthèse, génomique, médicament, molécules hybrides

Face à des dogmes religieux qui donnaient la priorité à l’irrationnel et à des prêtres qui faisaient torturer et tuer ceux qui n’y croyaient pas, la construction de la théorie de l’évolution fût lente et souvent dramatique. C’est aujourd’hui le fondement incontournable de la biologie, même si elle reste l’objet d’attaques frontales dans les théocraties et aux Etats Unis.1er volet du cycle de conférences "De l'Histoire à l'actualité des sciences". Pour voir les deux volets suivants : 2. L'évolution détournée : par le plaisir puis par les humains. 3. les Humains : une longue histoire puis un retour à la nuit des temps.
Mot(s) clés libre(s) : population, génome, selection naturelle, théorie de l'évolution, espèce

Conférence du docteur Xavier Gidrol sur l'impact des nanotechnologies en médecine. La conférence a été donnée à l'Université Victor Segalen Bordeaux 2 dans le cadre du cycle de conférences "L'invité du Mercredi" / Saison 2005-2006 sur le thème "L'espoir". Service culturel Université Victor Segalen de Bordeaux 2 / DCAM /
Mot(s) clés libre(s) : biopuce, biotechnologie, génomique, génomique fonctionnelle, puce à ADN