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Titre
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A combined laser microdissection and mass spectrometry method for proteomic analysis of tissue sections for the indentification of tumor signatures
/ Université de Bordeaux - Service Audiovisuel et Multimédia
/ 10-11-2015
/ Canal-u.fr
RAYMOND Anne-Aurélie
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Clinical and biological samples : opportunities and challenges for translational research
A challenge in oncology is to better define the
tumor of the patient to study the pathology and of course to find and to use
the right treatment. Genetic and transcriptomic analyses allow a cancer
classification, and give a lot of informations concerning carcinogenesis.
However, the proteomic analysis can complete the genomic analysis and precise
the tumor features.
With the Frederic Saltel’s group within the
INSERM 1053 Unit of Bordeaux, we have already developed a new method of
proteomic analysis of subcellular compartments after laser microdissection that
has been the object of a patent registration. Resulting from a know-how
acquired during the development of this new method, we have developed a
procedure combining laser microdissection and mass spectrometry analysis to
identify and compare the levels of protein expression between two tissues
pieces of formalin fixed paraffin embedded tissue sections. Our approach
presents the principal advantage to be compatible with biopsy, the current
biological material available for clinical assays. Moreover, with this approach
we will obtain quantitative data in comparison with classical
immunohistochemistry.
Our subject of study in the laboratory is the
hepatocellular carcinoma (HCC), the sixth most prevalent cancer and the third
most frequent cause of cancer-related death. We already validated our protocol
on two cases of HCC and one low-grade dysplastic nodule, one of the earlier
stages of liver carcinogenesis. Now, we want to enlarge our analyses on a
bigger cohort to compare the proteome of the different stages of liver
carcinogenesis. We will use the proteomic data to generate proteomic signatures
of each stage of liver carcinogenesis and validate the signatures generated.
Finally we will propose a new tool for tumor characterization and biomarkers
quantification that can be applicable in clinic.
Cette présentation a été donnée dans le cadre du BRIO SIRIC
scientific day 3 organisé annuellement par le SIRIC BRIO et qui a pour but de
réunir tous les acteurs du SIRIC BRIO et plus largement de la cancérologie à
Bordeaux. Mot(s) clés libre(s) : cancer, Oncologie, Thérapie, Recherche
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L'hôpital de demain
/ UTLS - la suite
/ 19-01-2004
/ Canal-U - OAI Archive
OMNES Louis
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Que sera l'hôpital de demain ? Répondre à cette question relève de la présomption, il s'agit d'un exercice difficile. Quand on parle de l'hôpital, de quoi parle-t-on ? Les hôpitaux ne constituent pas une famille homogène. Développer un point de vue à valeur générale sur des établissements différents par leur histoire, par leur taille et leur environnement est un peu réducteur. Le monde de l'hôpital est le monde de la complexité, qui met en relation trois formes de constructions fortement imbriquées : l'architecture des technologies, l'architecture du système d'information et de communication et celle, plus complexe, des relations humaines. Il est difficile de faire une projection dans le futur de cet ensemble dont les composantes évoluent à des rythmes différents ou émettent des signes de nature et intensité variables. Est-il possible de concilier le temps très court des progrès médicaux et le temps long d'évolution des mentalités, des comportements, voire un temps très long d'évolution des organisations ? Mot(s) clés libre(s) : gériatrie, hopital, thérapie
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Semaine de la recherche thérapeutique - Arnold MUNNICH
/ Canal-U/Sciences de la Santé et du Sport
/ 23-03-2009
/ Canal-U - OAI Archive
MUNNICH Arnold
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Conférence d'Arnold MUNNICH pour le CEnGEPS Mot(s) clés libre(s) : Centre d'Investigation Clinique, CHU, maladie, Pédiatre généticien, thérapie génique
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JACOTES 2011 – Association radiothérapie et thérapies ciblées : avancées en 2011, perspectives.
/ Canal-U/Sciences de la Santé et du Sport, CERIMES
/ 13-05-2011
/ Canal-U - OAI Archive
MORNEX Françoise
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Titre : JACOTES 2011 – Association radiothérapie et thérapies ciblées : quelles avancées en 2011, quelles perspectives ? Intervenant : Françoise MORNEX (Radiothérapie, Centre Hospitalier, Lyon Sud).Résumé : Domaine très prometteur, bonne méthodologie de développement, schémas exigeants parfois lourds, collaboration internationale, tel est le vécu habituel de ces associations.L’auteur n’a pas transmis de conflit d’intérêt concernant les données diffusées dans cette vidéo ou publiées dans la référence citée.Conférence enregistrée lors des 2ème Journées d’Actualité en Oncologie Thoracique de l’Est (JACOTES) - 13 et 14 mai Mémorial Charles de Gaulle Colombey les 2 Eglises. Présidente : Virginie WESTEEL (Professeur, CHU de Besançon). Modérateurs : Bertrand MENNECIER (CHU de Strasbourg) et Dominique SPAETH (Clinique de Gentilly, Nancy)Organisé avec le partenariat de l’UNF3S/UMVF Réalisation, production : Canal U/3S - CERIMES Mot(s) clés libre(s) : JACOTES 2011, oncologie, pneumologie, radiothérapie, thérapies
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How studying hematological malignancies subtypes may inform epidemiologic and clinical research
/ Université de Bordeaux - Service Audiovisuel et Multimédia
/ 10-11-2015
/ Canal-u.fr
MONNEREAU Alain
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Epidemiology
and public health
The aim
of the talk entitled "How studying hematological malignancies (HM)
subtypes may inform epidemiologic and clinical research" is to bring to
the audience several examples from recent epidemiological studies showing the
benefit of studying HM subtypes : 1) a population-based incidence study in
France on HM identified trends in incidence for specific subtypes that help to
generate etiological hypothesis, 2) An International initiative on lymphoma
subtypes pooled 20 case-control studies to distangle etiological factors, 3)
population-based survival study in France identifies progress in survival for
specific subtypes. Overall, this approach led to recent progresses in
understanding HM.
Cette présentation a été donnée dans le cadre du BRIO SIRIC
scientific day 3 organisé annuellement par le SIRIC BRIO et qui a pour but de
réunir tous les acteurs du SIRIC BRIO et plus largement de la cancérologie à
Bordeaux. Mot(s) clés libre(s) : cancer, Oncologie, Thérapie, Recherche
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Life of a sample
/ Université de Bordeaux - Service Audiovisuel et Multimédia
/ 10-11-2015
/ Canal-u.fr
MERLIO Jean-Philippe
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Clinical
and biological samples : opportunities and challenges for translational
research
The first purpose of this talk is to provide ton
non clinical researchers some main technical, ethical and reglementary issues
for their access to biological samples and especially tumoral tissues which are
stored in pathology departments or tumor
banks. The second one is to explain to
scientists that their project will not be successful if the sample collection
is not associated with relevant clinical and biopathological annotations
Finally, financial and ethical problems will be
discussed as cancer biobanks funding becomes problematic and there is also an
urgent need to refine their policy considering the most frequent tumor subtypes
which may be available in several biobanks with redundancy and the access of
researchers to routine diagnostic samples or rare tumor subtypes which are not
primarily stored for research but that can be qualified for research by an
Ethical Committee.
Samples collected in daily practice are of
diverse origins and subtypes: fresh
tissues, cell suspension, fixed biopsies, surgical specimens. All of them may
be altered by adverse preanalytical factors such as cold ischemia, delayed
fixation or freezing times which are not always known parameters. Therefore,
research collection can be set up with knowledge of these parameters and
alternative procedures such as RNA later prior to freezing. Accreditation of
pathology department will also make possible to limit preanalytical artefacts
which are critical according to the tissue subtype and technique used for
analysis with robust and more sensitive ones.
The research collection needs to be associated
with basic clinical and pathological parameters but all of them are only
available when a clinical database with evolutive features is designed and
maintained. Despite the efforts of these clinical databases, the life of the
sample needs to be managed independently at the biopathology level. In fact
there are two different situations: one
is when the cancer biobank and the biopathology department directly involved in
the research project. Another seen at the Bordeaux University Hospital is when
more than 10 research collection are setup in the context of regional, national
or international project with centralized management and funding of the
clinical database as well as of the scientific advisory board for access to the
samples. Despite the presence of such
clinical database, the scientific project cannot be conducted without a
specific reanalysis of biopathological data owing to the diversity of tumour
histological and genetic subtypes, especially when changes in the
classification of the tumor subtypes (lung, liver, lymphoma for example) have
occurred. Both clinicians and scientists are not aware that their project will
not only need funding for access to tissue but that they will need to involve
an expert biopathologist in their project.
Whatever the tumor bank subtype, the process
for storing, management and sample access are regulated through certified
procedure NFS 96900 in France. Finally, the access to sample is restricted by
ethical and regulatory procedures for which the tumor bank is not in charge but
has together with the researcher to cope with.
Cette présentation a été donnée dans le cadre du BRIO SIRIC
scientific day 3 organisé annuellement par le SIRIC BRIO et qui a pour but de
réunir tous les acteurs du SIRIC BRIO et plus largement de la cancérologie à
Bordeaux. Mot(s) clés libre(s) : cancer, Oncologie, Thérapie, Recherche
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BRIO supporting action to integrated cancer research in Bordeaux
/ Université de Bordeaux - Service Audiovisuel et Multimédia
/ 10-11-2015
/ Canal-u.fr
MEONI Paolo
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About
BRIO Siric challenges and actions
The success
of BRIO’s approach and the realization of its potential impact on the
translational research community in Bordeaux rely both on the efficient
delivery of research outcomes as well as on the creation of efficient, service-oriented
transversal platforms. Specific tools were adapted to this purpose and
implemented over the past year. Calls for proposals were launched, program
management tools implemented and a specific metrology capable of facilitating
the coordination of BRIO’s scientific activities developed. To maximise the delivery of solutions
developed within BRIO, integration in the regional and national context was
sought. Scientific mediation activities will further complement this
structuring approach to insure the consolidation of a translational research
culture and community in Bordeaux.
Cette présentation a été donnée dans le cadre du BRIO SIRIC
scientific day 3 organisé annuellement par le SIRIC BRIO et qui a pour but de
réunir tous les acteurs du SIRIC BRIO et plus largement de la cancérologie à
Bordeaux. Mot(s) clés libre(s) : Oncologie, Thérapie, Recherche
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Les bases génétiques des maladies et le diagnostique génique - Jean-Louis MANDEL
/ UTLS - la suite, Mission 2000 en France
/ 17-03-2000
/ Canal-U - OAI Archive
MANDEL Jean-Louis
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"Le projet du décryptage du génome humain a permis une explosion des connaissances en ce qui concerne les maladies héréditaires, aussi dites maladies monogéniques. Ces maladies sont en effet dues à des ""erreurs"" du matériel génétique (mutations), au niveau d'un gène. On en compte plus de 4000, qui sont souvent responsables de handicaps physiques, sensoriels ou intellectuels importants, ou de mortalité précoce, chez les personnes atteintes. A l'heure actuelle, on a identifié le gène défectueux pour plus de 900 maladies monogéniques, et ce chiffre augmente d'environ 3 par semaine. Au plan des connaissances, l'identification des gènes a révélé des mécanismes insoupçonnés d'erreurs génétiques, expliquant des modes de transmission très particuliers de certaines. L'identification des gènes de maladies permet aussi des progrès très importants dans la compréhension des mécanismes de phénomènes complexes, tels que le fonctionnement des fibres musculaires, l'audition ou la vision. Ces recherches visent à mieux comprendre ces maladies et à définir de nouvelles cibles pour le développement de thérapeutiques.Leur intérêt ne réside pas dans la mise en place d'une médecine ""prédictive"" assez illusoire (sauf dans les cas éventuels d'un risque élevé où un traitement préventif serait possible), car les facteurs génétiques de prédisposition ne permettent pas en fait de prédire la maladie. " Mot(s) clés libre(s) : ADN, dystrophine, famille, génétique, maladie, maladie génétique, mutation, thérapie génique
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Médicaments, économie, société - Claude LE PEN
/ Mission 2000 en France
/ 24-03-2000
/ Canal-U - OAI Archive
LE PEN Claude
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"Le médicament est l'un des biens de consommation courante les plus fascinants de notre société. Son usage remonte à la plus haute antiquité, mais il existait peu de médicaments vraiment actifs avant la première moitié de ce siècle. Il comprend des composés chimiques très actifs, mais son action est aussi psychologique. Il est à la fois un bien industriel et un bien de santé publique. Il est à la fois un bien marchand et un bien essentiellement financé sur fonds publics. Son marché tend à devenir mondial, mais le poids des pratiques locales reste encore très fort. La France est le plus gros consommateur de médicaments par habitant du monde développé. Ce fait, incontestable, ne laisse d'intriguer. En fait la spécificité française résulte vraisemblablement d'une constellation de facteurs multiples, touchant aussi bien à l'offre qu'à la demande, que l'on retrouve individuellement dans d'autres pays, mais dont les effets combinés ont débouché en France sur une ""économie de volume"". Le faible prix des médicaments, les structures industrielles, les modes de régulation économiques des soins ambulatoires, les représentations collectives de la maladie et des soins, sont autant d'éléments constitutifs de cette économie qui est aujourd'hui en crise. Cette crise n'est pas tant une crise financière qu'une crise de ""sens médical"". Il faut aujourd'hui comprendre avec précision les mécanismes d'action des médicaments, en évaluer scientifiquement les effets, en codifier les prescriptions. Un grand nombre de molécules, largement consommées, sont contestées au nom d'un ""service médical"" jugé ""insuffisant"". On change d'univers, le médicament innovant ne pouvant plus prétendre à un statut de bien de consommation, mais à celui d'une technologie de pointe dont la généralisation aura des effets restructurants sur l'ensemble du système de santé et notamment de l'offre de soins. " Mot(s) clés libre(s) : éthique, médicament, monopole, placebo, santé, sécurité sociale, thérapie
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Médicaments, économie, société
/ Mission 2000 en France
/ 24-03-2000
/ Canal-u.fr
LE PEN Claude
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Le médicament est l'un des biens de consommation courante les plus fascinants de notre société. Son usage remonte à la plus haute antiquité, mais il existait peu de médicaments vraiment actifs avant la première moitié de ce siècle. Il comprend des composés chimiques très actifs, mais son action est aussi psychologique. Il est à la fois un bien industriel et un bien de santé publique. Il est à la fois un bien marchand et un bien essentiellement financé sur fonds publics. Son marché tend à devenir mondial, mais le poids des pratiques locales reste encore très fort. La France est le plus gros consommateur de médicaments par habitant du monde développé. Ce fait, incontestable, ne laisse d'intriguer. En fait la spécificité française résulte vraisemblablement d'une constellation de facteurs multiples, touchant aussi bien à l'offre qu'à la demande, que l'on retrouve individuellement dans d'autres pays, mais dont les effets combinés ont débouché en France sur une ""économie de volume"". Le faible prix des médicaments, les structures industrielles, les modes de régulation économiques des soins ambulatoires, les représentations collectives de la maladie et des soins, sont autant d'éléments constitutifs de cette économie qui est aujourd'hui en crise. Cette crise n'est pas tant une crise financière qu'une crise de ""sens médical"". Il faut aujourd'hui comprendre avec précision les mécanismes d'action des médicaments, en évaluer scientifiquement les effets, en codifier les prescriptions. Un grand nombre de molécules, largement consommées, sont contestées au nom d'un ""service médical"" jugé ""insuffisant"". On change d'univers, le médicament innovant ne pouvant plus prétendre à un statut de bien de consommation, mais à celui d'une technologie de pointe dont la généralisation aura des effets restructurants sur l'ensemble du système de santé et notamment de l'offre de soins. Mot(s) clés libre(s) : éthique, santé, sécurité sociale, médicament, monopole, placebo, thérapie
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