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Cinétique enzymatique mono substrat
/ Université de Montpellier-II, Unisciel
/ 2011
/ Unisciel
Bobillo Pascale
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Les réactions chimiques de la vie sont sous la dépendance des enzymes et les mesures de cinétique des réactions enzymatiques sont parmi les moyens d'approche les plus performants pour élucider les mécanismes catalytiques des enzymes. Dans ce chapitre, nous explorerons le mécanisme catalytique d’une enzyme Michaëlienne qui n’utilise qu’un seul substrat à l’ Etat Quasi Stationnaire. De nombreuses substances modifient l'activité d'une enzyme en se combinant à elle, ce qui se traduit par une modification de la vitesse d'apparition du produit. Ces effecteurs agissent soit sur la liaison du substrat soit sur le turnover, soit sur ces deux paramètres. Ils peuvent alors activer ou inhiber l’activité enzymatique. Mot(s) clés libre(s) : cinétique enzymatique, monosubstrat, Michaëlis, état quasi stationnaire, effecteurs, inhibiteurs, activateurs
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Biochimie structurale et fonctionnelle
/ Université de Montpellier-II, Unisciel
/ 2011
/ Unisciel
Bobillo Pascale
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Les expériences de cinétique et de liaison à l’équilibre sont incontournables pour étudier les
réactions biologiques. Ce cours aborde le formalisme de la cinétique formelle et enzymatique
ainsi que les liaisons (sites indépendants et allostérie), donc toutes les notions de bases
nécessaires à l’interprétation des réactions biologiques. Mot(s) clés libre(s) : formalisme, cinétique, enzyme, enzymologie, Michaëlis, état quasi-stationnaire, pré équilibre rapide, effecteur, activateur, inhibiteur, liaison, coopérativité, allostérie
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Colloïdes et biotechnologies
/ UTLS - la suite
/ 29-10-2002
/ Canal-U - OAI Archive
BIBETTE Jérôme
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L'exposé introduit lutilisation des colloïdes dans le domaine du diagnostic biologique. Nous introduirons les bases de la physico chimie des colloïdes ainsi que les approches classiques du diagnostic biologique: test d'agglutination à partir de particules de Latex ou dor, test ELISA avec des particules magnétiques. Ensuite nous présenterons une nouvelle approche de diagnostic basée sur la formation de nano structures colloïdales magnétiques. Le principe repose sur l'aptitude de certains colloïdes magnétiques, à la fois suffisamment petits et susceptibles, à former rapidement des lignes réversibles sous champ. Nous montrerons que cette solution colloïdale change de couleur sous l'action d'un champ magnétique, conséquence de la diffraction des chaînes auto assemblées, et comment ce phénomène peut conduire à la détermination du profil de force entre colloïdes. Si les particules sont greffées par un anticorps, alors en présence de l'antigène spécifique capable de ponter deux anticorps, les lignes peuvent devenir permanentes et quasi irréversibles. Nous discuterons comment la persistance des lignes peut révéler de manière très sensible la quantité d'antigène introduite, et pourquoi la force magnétique imposée à chaque colloïde peut accélérer la complexation antigène anticorps. Nous finirons par une introduction à l'utilisation des colloïdes en micro fluidique. Nous montrerons comment les auto assemblages magnétiques peuvent devenir des matrices de séparation très efficaces pour des entités biologiques comme des ADN génomiques ou des cellules. Mot(s) clés libre(s) : biotechnologie, colloïde, diagnostic biologique, matériau, matière divisée, matière molle, microfluidique, nanomatériau, phase, physico-chimie, physique de la matière condensée, science des matériaux
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Voie des pentoses phosphates
/ BioMedia-UPMC
/ 12-11-2008
/ Unisciel
Benlot Caroline, Blanchouin Nicole
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La voie des pentoses phosphates (ou voie du phosphogluconate) génère du NADPH, indispensable aux réactions réductrices de biosynthèse (en particulier, lors de la synthèse des acides gras et des stéroïdes). Cette voie est présente essentiellement dans le cytosol des cellules des glandes mammaires, du tissu adipeux, du foie et du cortex surrénal. Outre le NADPH, la voie des pentoses phosphates produit du ribose 5-phosphate précurseur de la synthèse des nucléotides, des acides nucléiques et de coenzymes. Mot(s) clés libre(s) : phosphogluconate, NADPH, acides gras, stéroides, Biochimie
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Réactions simples
/ BioMedia-UPMC
/ 04-11-2008
/ Unisciel
Benlot Caroline, Blanchouin Nicole
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Les types de réactions simples rencontrés dans le catabolisme sont principalement des réactions :
de simple transfert
d'oxydo-réduction
de rupture/synthèse de squelette carboné
d'addition/élimination
d'isomérisation Mot(s) clés libre(s) : transfert, oxydo-réduction, isomérisation, Biochimie
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Propriétés de la respiration mitochondriale chez les plantes
/ BioMedia-UPMC
/ 12-11-2008
/ Unisciel
Benlot Caroline, Blanchouin Nicole
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La chaîne respiratoire des mitochondries des plantes est caractérisée par la présence de multiples NAD(P)H déshydrogénases (ou NDH) localisées dans la membrane interne. Outre le complexe I commun à toutes les mitochondries (qui oxyde le NADH matriciel), deux NAD(P)H déshydrogénases supplémentaires sont présentes : l'une interne (face matricielle) et l'autre, dite externe, orientée vers le cytosol. Ces deux déshydrogénases oxydent respectivement le NAD(P)H matriciel provenant du cycle de Krebs et le NAD(P)H cytosolique. Elles court-circuitent le complexe I, donc le premier site de translocation des protons, et sont insensibles à la roténone, inhibiteur du complexe I. Mot(s) clés libre(s) : mitochondrie, NADH, déshydrogénase, respiration, Biochimie
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Phosphorylation oxydative
/ BioMedia-UPMC
/ 04-11-2008
/ Unisciel
Benlot Caroline, Blanchouin Nicole
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La chaîne respiratoire est localisée dans la membrane interne mitochondriale. Cette chaîne de transport d'électrons est constituée de quatre complexes protéiques :
complexe I : NADH-coenzyme Q oxydoréductase,
complexe II : succinate-coenzyme Q oxydoréductase,
complexe III : coenzyme Q-cytochrome c oxydoréductase,
complexe IV : cytochrome c oxydase. Mot(s) clés libre(s) : mitochondrie, NADH, succinate, cytochrome, Biochimie
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Néoglucogenèse
/ BioMedia-UPMC
/ 12-11-2008
/ Unisciel
Benlot Caroline, Blanchouin Nicole
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La néoglucogenèse est la formation de glucose à partir de précurseurs non glucidiques tels que le pyruvate, le lactate, le glycérol et la plupart des acides aminés. Chez les animaux supérieurs, elle se produit essentiellement dans le foie et, à un moindre degré dans le cortex rénal. Ses réactions sont les mêmes chez les animaux, les végétaux, les champignons et les micro-organismes. Mot(s) clés libre(s) : glucose, lactate, pyruvate, glycérol, Biochimie
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Les navettes
/ BioMedia-UPMC
/ 04-11-2008
/ Unisciel
Benlot Caroline, Blanchouin Nicole
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Les cellules eucaryotes possèdent des navettes permettant de transférer les électrons du NADH cytosolique dans la mitochondrie, sans que la molécule soit elle-même transportée à travers la membrane interne. Mot(s) clés libre(s) : glycérol phosphate, malate aspartate, Biochimie
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Les corps cétoniques
/ BioMedia-UPMC
/ 12-11-2008
/ Unisciel
Benlot Caroline, Blanchouin Nicole
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Une grande partie de l'acétyl CoA produit par la dégradation des acides gras et du glucose est oxydée dans le cycle de Krebs. Cependant, une fraction de cet acétyl CoA est transformée au niveau des cellules hépatiques en corps cétoniques (acétoacétate, D-946;-hydroxybutyrate et acétone). L'acétone, formée en plus petite quantité est exhalée. L'acétoacétate et le D-946;-hydroxybutyrate sont transportés par le sang vers les tissus extrahépatiques (muscle squelettique, muscle cardiaque, cortex rénal) où ils sont oxydés dans le cycle de Krebs pour fournir une grande partie de l'énergie. Le cerveau, qui utilise normalement le glucose comme source d'énergie, va se servir des corps cétoniques en cas de carence en glucose (par exemple lors d'un jeûne prolongé). Mot(s) clés libre(s) : Acétyl CoA, foie, acétone, acides gras, glucose, Biochimie
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