Martin Karplus revient sur ce prix Nobel attendu par ses pairs depuis près de 30 ans (mais sur lequel lui-même ne comptait plus) ; sur ce que cela change pour lui et ses collaborateurs, et ce qu’il ne veut surtout pas voir changer ! Il souligne à quel point ce prix Nobel est la consécration d’un champ disciplinaire pas toujours reconnu ; l’importance des simulations numériques dans la recherche et la force des résultats qu’elles peuvent amener. Il revient également sur les choix de vie et de carrière qui l’ont mené à Strasbourg et donne sa vision de la recherche française et américaine.  
Mot(s) clés libre(s) : simulations numériques, modélisation moléculaire en chimie

L’activité de notre association Charles Gide reprend, pour son cycle de conférences "le forum Nîmois Charle GIDE" Jean MATOUK président de l'assosiation et professeur des universités recoit, le 19 novembrel 2015, à la maison du protestantisme à Nîmes Philippe Kourilsky. Philippe Kourilsky, nous sommes très heureux de vous accueillir au Forum pour nous éclairer sur des problèmes auxquels les chercheurs, et les médecins qui les accompagnent, sont confrontés constamment, dont le grand public n’est que vaguement au courant, alors même qu’il attend de la recherche biologique, la santé, la survie et, pour les plus transhumanistes, la vie presque éternelle. On peut presque dire que votre route était tracée  dès votre premier souffle puisque vous êtes fils d’un professeur de médecine et d’un médecin. An départ, vous avez fait un écart, mais un écart brillant, car vous êtes entré à Polytechnique, ce qui pouvait vous mener aux sciences dites dures. Mais vous avez ensuite fait retour à la biologie avec une thèse sous la direction de François Gros. Vous avez effectué la majeure partie de votre carrière au CNRS ou vous avez terminé évidemment a-t-on envie de dire, Directeur de recherche. Vous êtes membre de l’Académie des sciences depuis 1997 et vous avez été nommé au Collège de France en 1998, pour la chaire d’immunologie moléculaire que vous avez occupée jusqu’en 2012. Cette chaire succédait à celle de biochimie cellulaire de votre maitre de thèse. L’importance prise par l’immunologie, montre qu’étudiant ses mécanismes au niveau moléculaire, vous avez ouvert des voies qui s’avèrent essentielle aujourd’hui. En 2000 vous êtes entré à l’Institut Pasteur dont vous fûtes directeur général jusqu’en 2005. Vous avez fondé une association Resolis, dont vous êtes président, qui se donne pour objet de ‘évaluer les solutions innovantes et sociales. Vous pourrez nous en dire un mot car au-delà de la présentation de membres très respectables, avec, je l’ai constaté avec plaisir, autant de femmes su d’hommes, le site de cette association n’est pas très explicatif. Vous avez écrit cinq livres importants, notamment sur le principe de précaution, mais aussi sur l’altruisme, et sur les essais cliniques dans les populations des pays pauvres. Le dernier de ces livres «  Le jeu du hasard et de la complexité » (Odile Jacob 2014) est présenté ici par notre libraire Siloe. Complexité, précaution éthique. Tels sont les trois termes de votre propos ce soir Pour la complexité, nous sommes bien contraints d’aller vers Edgar Morin dont le livre de 1982 Science et conscience formule la première définition de la pensé complexe. Je le cite : « Le but de la recherche n’est pas de trouver un principe unitaire de toute connaissance, mais d’indiquer les émergences d’une pensée complexe, qui ne se réduit ni à la science, ni à la philosophie, mais qui permet leur intercommunication opérant des boucles dialogiques ». Il y a, évidemment, l’extrême complexité interne à la biologie elle-même. La complexité de l’organisme humain, qui est aussi notre capacité à nous maintenir en vie, et à corriger de nous-mêmes nos déséquilibres. Mais il y a la complexité inter-disciplinaires, tant la physiologie de l’homme est liée à son milieu, son comportement. Tout le monde  comprend, plus ou moins vaguement aujourd’hui, que la santé et la thérapie, par exemple, ne sont pas liées qu’à la biologie, mais aussi à la psychologie, à l’anthropologie, à la sociologie.  Je voudrais énoncer un fait statistique indiscutable, qui vient d’être révélé pour Londres, mais l’est aussi pour Paris : l’espérance de vie, et l’espérance de vie en bonne santé, sont bien plus basses à l’est des capitales, l’East end de Londres, même s’il se boboïse actuellement, comme l’est de Paris, ce qui recoupe évidemment la distribution géographiques des revenus. Bien plus que les chercheurs en sciences dures, sauf si l’on va au fin fond de la matière et de l’histoire de l’Univers, les chercheurs en  sciences biologiques font face à une énorme complexité, que, je pense, vous allez exposer mieux que moi. Précaution ! Vous avez donc, dans un ouvrage fait une critique, au sens philosophique du mot, du principe de précaution que Jacques Chirac a eu l’imprudence – mais il n’y a pas eu alors de mouvements populaires contre lui pour cela- d’inscrire dans la Constitution. L’origine latine du mot, c’est « precavere » prendre garde. Je pense que tous les médecins prennent spontanément garde depuis toujours à ne pas tuer le patient pour le guérir. Mais imposé à la biologie, qui est en amont des soins, avant, bien  avant l’autorisation de pratiquer une thérapie ou de mettre un médicament sur le marché, elle doit effectivement être très entravant. Vous allez, je pense, nous le dire. Enfin, éthique ! Là nous sommes en pleine « actu » comme disent les journalistes. Quand commence la vie à laquelle il est interdit de  mettre fin ? Comment tester des thérapies sur l’homme, quand elles ne l’ont été que sur l’animal ? Si l »’on est certain de l’efficacité d’un traitement mais pas de tous ses effets secondaires, est-il légitime de pratiquer l’expérience en double aveugle, bloquant temporairement c’est vrai,l’accès à la guérison pour la moitié des cobayes ? Ou doit s’arrêter l’« augmentation» de l’homme que souhaitent les transhumanistes, et au bord de laquelle nous sommes ? Enfin bien sûr, est-ce encore une vie que l’état d’un patient en coma sans chances objectives de recouvrer la conscience ? Un patient n’a-t-il pas le droit quand l’issue est certains à court terme, de mettre lui-même finaux jours de souffrances ou de dépendance totale qui s’annoncent ? Vous n’allez pas ce soir, Philippe Kourilsky, répondre à ces questions remplaçant les comités divers de bioéthique qui ont déjà bien du mal à proposer des avis. Mais vous allez nous décrire, comme vous me l’avez excellemment suggéré, l’écartèlement de la recherche médicale entre ces réalités et ces impératifs
Mot(s) clés libre(s) : biochimie, immunologie, chimie moléculaire

“Ni tout à fait la même, ni tout à fait une autre“. Comment cette vision poétique de l’identité peut-elle être déclinée le long des différentes échelles biologiques, de l’espèce à la cellule, de l’individu à son ADN ? Les déterminants biologiques de l’identité suffisent-ils à nous identifier, à construire et définir notre pensée, notre comportement? Gardent-ils en mémoire notre histoire collective et individuelle ? Catherine Dargemont est directeur de recherche au CNRS, responsable d’une équipe à l'Hôpital Saint Louis et coordonne le Labex “Who Am I?” avec J. Weitzman
Mot(s) clés libre(s) : cellule, pareil que, différent de, êtres humains, identité d'une cellule, fonction de la cellule, pore nucléaire, ATGC, chromosome, cellule fille, cellule mère, paire de base, sélection positive, individualité, carte d'identité, acquis, noyau, ADN, polymère, épigénétique, mutation, embryon, régénération, adaptation à l'environnement, LABEX, inné, identité mathématique, concept biologique, identité moléculaire

L'idée que les modifications que subissent les espèces au cours de l'évolution sont causées par des altérations du développement de l'embryon est apparue dès le XIXe siècle. Néanmoins, l'ignorance dans laquelle nous étions des mécanismes fondamentaux de l'embryogenèse, c'est-à-dire le développement progressif d'un animal juvénile composé de milliers de cellules, de tissus différenciés et d'organes complexes à partir d'une seule cellule, l'oeuf fécondé, a empêché jusqu'à une date récente toute avancée significative dans le domaine des mécanismes embryologiques de l'évolution. Cette situation a radicalement changé depuis une trentaine d'années. Des progrès considérables ont été faits dans la compréhension de la façon dont les gènes contrôlent le développement de l'embryon. Pour la première fois, des exemples convaincants du rôle possible de certains gènes dans l'évolution de la morphologie des animaux ont été proposés. Au cours de mon exposé, je souhaite donner un aperçu historique de la relation entre embryologie et évolution. J'essaierai d'expliquer à quel point la découverte des gènes homéotiques et de leur conservation chez la plupart des animaux a été révolutionnaire pour la biologie du développement. Dans une troisième partie, j'expliquerai comment certains de ces gènes peuvent avoir été impliqué dans l'évolution du plan d'organisation des animaux.
Mot(s) clés libre(s) : animal, biologie du développement, embryologie, embryon, évolution, gène homéotique, gènes HOX, génétique, génétique moléculaire

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Mot(s) clés libre(s) : ADN, biophysique, hélicase, kinésine, molécule unique, moteur moléculaire, piège magnétique, pince optique, protéine motrice, transport intra-cellulaire

La PCR, l'opéron lactose, le code génétique, la traduction, le génotype, le phénotype, la dominance et la recessivité, dominance d'un phénotype mutant, le test de complémentation fonctionnelle, les suppresseurs, chromosomes balanceurs et élément P, les conséquences génétiques de la méiose. De nombreuses animations Flash.
Mot(s) clés libre(s) : code, opéron, traduction, génotype, phénotype, Biologie moléculaire, Génétique

L'étude de l'opéron lactose permet de décrire un système de régulation des gènes. La régulation de l'opéron lactose est ici illustrée grâce à plusieurs panneaux qui s'ouvrent sur des séquences animées (logiciel d'animation Flash5). Différentes conditions de croissance sont présentées par un texte court et une animation, On peut ainsi voir : la régulation négative, la levée de l'inhibition de la transciption et la répression catabolique..
Mot(s) clés libre(s) : lactose, Biologie moléculaire

La biosynthèse des protéines, ou traduction, est un processus complexe qui nécessite l'action contrôlée de nombreuses macromolécules. Dans ce document, nous présentons l'enchaînement des différentes étapes de la biosynthèse des protéines (initiation, élongation et terminaison) sous forme de schémas légendés. Il est ainsi possible de visualiser les interactions des différents acteurs de cette biosynthèse accompagnées de commentaires (logiciel d'animation Flash5).
Mot(s) clés libre(s) : Acides aminés, ARN, ribosome, Biologie moléculaire

La réaction PCR (Polymerase Chain Reaction) permet d'amplifier in vitro une région spécifique d'un acide nucléique donné afin d'en obtenir une quantité suffisante pour le détecter et l'étudier. Pour ce faire, une série de réactions permettant la réplication d'une matrice d'ADN double brin est répétée en boucle. Ainsi, au cours de la réaction PCR, les produits obtenus à la fin de chaque cycle servent de matrice pour le cycle suivant, l'amplification est donc exponentielle. Illustrations en animations Flash.
Mot(s) clés libre(s) : ADN, amplification, hybridation, polymérase, Biologie moléculaire

Ce document présente le tableau du code génétique qui permet d'avoir une correspondance entre la séquence nucléotidique et la nature de l'acide aminé. Grâce à des animations réalisées avec le logiciel Flash5, on peut : lire le tableau du code génétique ; aborder la notion de redondance du code génétique ; lire le code génétique à 3 lettres et à 1 lettre ; connaître quelques curiosités du code génétique.
Mot(s) clés libre(s) : Code génétique, codon, Biologie moléculaire