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Emois 2008 - Evaluation d'une méthode d'estimation de l'incidence du cancer colo-rectal
/ Canal U/Tice Médecine Santé
/ 30-05-2008
/ Canal-U - OAI Archive
Quantin Catherine
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Résumé : Présentation des résultats préliminaires d'un projet faisant intervenir les registres et les établissements de santé publics et privés de Côte d'Or et du Doubs.Intervenant : Professeur Catherine QUANTIN, du service de biostatistique et information médicale au CHU de Dijon.SCD Médecine. Mot(s) clés libre(s) : algorithme de sélection, cancer colo-rectal, EMOIS 2008, PMSI, registre
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EMOIS Nancy 2011 - Indicateurs d’épidémiologie descriptive en vue d’un tableau de bord de cancers
/ Canal-U/Sciences de la Santé et du Sport, CERIMES
/ 18-03-2011
/ Canal-U - OAI Archive
LASALLE Pascal
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Titre : Indicateurs d’épidémiologie descriptive en vue d’un tableau de bord de cancers en Ile-de-France 2006-2009.Résumé : L’augmentation de l’incidence des cancers représente une préoccupation de Santé Publique et un impact médico-économique significatif. Il s’agit de la première cause de décès et d’inscription en Affection de Longue Durée (ALD30) en Ile-de-France. Des indicateurs épidémiologiques, prolongeant l’étude Epidémiologie des Cancers en Ile-de- France (ORS IDF, 2006), peuvent contribuer à un tableau de bord. Par sa population importante, le volume d’activité et l’attractivité, l’Ile-de-France permet de vérifier la faisabilité de ce tableau.Méthodes : A partir du PMSI traité par DAC (Diagnostic Principal; Diagnostics Associés) et d’autres systèmes (bases de l’Assurance maladie, INSERM CepiDC, Francim), des tendances furent étudiées. Le diagnostic a été fondé sur la CIM-10 par des cancérologues. Le chaînage des séjours définit un univers de patients. Après ventilation selon la résidence pour les non-Franciliens, les taux furent standardisés sur la population francilienne. Une description par sexe, classe d’âge, département, CIM-10, durées de séjours, fut effectuée. Ces résultats furent complétés par : ALD, estimations Francim, mortalité.Résultats : Nous avons obtenu les évolutions sur 5 ans (2006-2010) de la morbidité par trois sources de données et de la mortalité pour les principaux appareils. L’analyse statistique confirme des tendances chronologiques pour des localisations fréquentes (augmentation des cancers bronchiques chez la femme). La confrontation des sources peut caractériser les tendances par appareil. Dans le tableau, d’autres indicateurs ont été intégrés : âge au diagnostic, durée de séjour, nombre de séances...Discussion : Une mise en correspondance des sources fut réalisée pour étudier les tendances de morbidité et de mortalité. La période d’observation fut limitée, car le chaînage est difficile avant 2006.Conclusion : Le recours aux bases dans une ALD aux traitements habituellement hospitaliers contribue à l’observation de tendances. Il s’inscrit dans un tableau de bord pour la prévention, le dépistage, le diagnostic et le traitement précoce de ces affections dont les coûts représentent une part significative des dépenses de santé.Intervenant : LASALLE Pascal.Conférence enregistrée lors des journées EMOIS 2011 à Nancy. Session : PMSI et épidémiologie II. Modérateurs Eliane ALBUISSON (CHU de Nancy) et Gilles CHATELIER (Association Robert Debré – Paris).Réalisation, production : Canalu U/3S, CERIMES.SCD Médecine. Mot(s) clés libre(s) : ALD, cancer, chaînage, CIM 10, EMOIS Nancy 2011, épidémiologie, PMSI, registre, tableau de bord
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EMOIS Nancy 2011 - Développement et évaluation d'un algorithme de notification
/ Canal-U/Sciences de la Santé et du Sport, CERIMES
/ 18-03-2011
/ Canal-U - OAI Archive
JOUHET Vianney
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Titre : Développement et évaluation d'un algorithme de notification des cas incidents de cancer au sein d'un système d'information régional.Résumé : Le registre général des cancers de Poitou-Charentes a développé un système d’information multi-sources rapprochant les informations codées du PMSI, des laboratoires d’anatomie pathologique et de l’Assurance Maladie. Une réflexion a été menée sur une méthode de sélection des enregistrements qualifiants pour la notification des tumeurs en privilégiant le codage du clinicien pour la topographie et le codage de l’anatomopathologiste pour la morphologie. Nous proposons de comparer cette approche avec une méthode utilisant la totalité des enregistrements à l’aide de mesures objectives.Méthodes: L’algorithme sélectionne de façon hiérarchique les enregistrements selon leurs typologies (type de source, acte CCAM de prélèvement ou de chirurgie au sein du RUM) pour cibler le praticien producteur. L’évaluation a été réalisée en calculant le rappel (sensibilité), la précision (valeur prédictive positive) et la F-Mesure (composite du rappel et de la précision) à partir de la comparaison des tumeurs notifiées automatiquement et des tumeurs validées par les médecins du registre.Résultats: L’évaluation a été réalisée à partir de 6145 dossiers validés qui correspondaient à 6327 tumeurs. On note une amélioration nette des performances avec l’approche sélective avec une F-Mesure de 0,81 contre 0,74. L’amélioration se fait surtout par un gain de précision et une augmentation moindre du rappel.Conclusion: Nous avons montré l’intérêt de ne pas utiliser l’ensemble de l’information pour la notification. Notre approche présente un net gain de précision montrant que nous avons surtout éliminé le bruit lié au codage imprécis ou erroné. L’approche hiérarchisée permet de ne pas altérer le rappel en adaptant les choix effectués à la complétude du dossier.L’amélioration des performances permet de favoriser une préparation rigoureuse du dossier pour faciliter la validation manuelle par un opérateur. Cette étape de validation reste cependant essentielle pour rattraper les erreurs et les absences de notification identifiées.Intervenant : JOUHET Vianney (Unité d’épidémiologie, de Biostatistique et registre des cancers de Poitou-Charentes, Faculté de médecine, Centre Hospitalier Universitaire de Poitiers, Université de Poitiers, 6).Conférence enregistrée lors des journées EMOIS 2011 à Nancy. Session : PMSI et épidémiologie II. Modérateurs Eliane ALBUISSON (CHU de Nancy) et Gilles CHATELIER (Association Robert Debré – Paris).Réalisation, production : Canalu U/3S, CERIMES.SCD Médecine. Mot(s) clés libre(s) : algorithme, codage, EMOIS Nancy 2011, notification, PMSI, registre des cancers, RUM, système d’information
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EMOIS Nancy 2011 - Alimentation d’un registre épidémiologique de pédiatrie
/ Canal-U/Sciences de la Santé et du Sport, CERIMES
/ 17-03-2011
/ Canal-U - OAI Archive
BAYAT Sahar
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Alimentation d’un registre épidémiologique de pédiatrie. Comparaison d’une recherche plein texte sur le dossier médical versus PMSI.Résumé : L’alimentation des registres épidémiologiques repose sur un recueil manuel de l’information. Avec le développement des SIH apparaît la possibilité d’alimenter semi automatiquement ces registres à partir des dossiers patients informatisés. Cependant, les données médicales numériques sont encore largement en plein texte. Nous démontrons l’intérêt d’utiliser ces sources de données non structurées, pour l’alimentation du registre breton des malformations congénitales. Nous comparons notre méthode au PMSI.Méthode : Le système repose sur un entrepôt de documents et de données biocliniques associé à un système de recherche d’information. La recherche est basée sur des mots clefs décrivant les pathologies « spina bifida » et « épi/hypospadias ». Un enrichissement sémantique avec la terminologie Snomed internationale a été effectué. Les requêtes PMSI sont basées sur les codes des deux pathologies. Les requêtes concernaient une période identique, en excluant pour la comparaison avec le PMSI les consultations externes.Résultats : La population d’intérêt comptait 6620 patients (16 512 comptes rendus). La meilleure requête plein texte identifie pour spina : 14 cas (dont 11 vrais positifs (précision 78,5%)) et pour Epi/Hypospadias 116 cas (dont 102 vrais positifs (précision 87 ,9%)). En excluant les consultations, le PMSI repère pour spina : 6 cas (dont 5 VP) versus 10 cas pour le plein-texte (dont 8 VP) avec une couverture plein texte/PMSI=83%. Pour hypospadias, le PMSI retrouve 88 cas (dont 87 VP), couverture plein-texte/PMSI=96,5%. Pour les deux pathologies, le plein-texte a identifié, à partir des consultations, 22 cas (dont 15 VP). Aucun gain n’est constaté avec l’enrichissement sémantique. Les FP étaient dus au contexte (ex : antécédent familial).Discussion/Conclusion : Le système démontre un excellent recouvrement du PMSI. Il était impossible de se comparer aux données du registre puisque celui-ci n’existait pas encore. L’étape ultérieure sera de le faire. D’autre part le système a montré son intérêt pour repérer des cas au-delà du PMSI, dans les courriers de consultation (non utilisé dans le codage).Intervenant : BAYAT Sahar (Unité Inserm U936, IFR 140, Faculté de Médecine, Université de Rennes 1, France).Conférence enregistrée lors des journées EMOIS 2011 à Nancy. Session : PMSI et épidémiologie. Modérateurs : V. GILLERON (CHU de Bordeaux), E. SAULEAU (CHU de Strasbourg).Réalisation, production : Canalu U/3S, CERIMES.SCD Médecine. Mot(s) clés libre(s) : codage, EMOIS Nancy 2011, épidémiologie, indexation, pédiatrie, PMSI, registre, SIH, système d'information hospitalier
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Emois 2008 - Outils d'identification des cas non incidents de tumeurs malignes de la prostate
/ Canal U/Tice Médecine Santé
/ 03-04-2008
/ Canal-U - OAI Archive
AVILLACH Paul
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Résumé : Présentation d'un travail ayant été réalisé au Registre Général des Cancers de la Gironde. Ce travail a porté sur l'étude d'un outil d'identification des cas non-incidents de la tumeur maligne de la prostate d'un registre de cancer à partir des données du PMSI.Intervenant : Dr. Paul AVILLACH, vice-président du syndicat des internes spécialistes. SCD Médecine. Mot(s) clés libre(s) : EMOIS 2008, PMSI, prostate, registre de cancer, tumeur
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EMOIS Nancy 2011 - Données médico-administratives pour l’estimation de l’incidence des cancers.
/ Canal-U/Sciences de la Santé et du Sport, CERIMES
/ 18-03-2011
/ Canal-U - OAI Archive
ABBAS Rachid
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Titre : Intérêt des bases de données médico-administratives pour l’estimation de l’incidence des cancers.Résumé : L'objectif de ce travail est d’évaluer sous quelles conditions les données médico-administratives collectées dans plusieurs pays, et notamment dans le cadre du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI) en France, pourraient être utilisées en épidémiologie pour évaluer l’incidence des cancers.Matériel et Méthodes : Les sources d’information médicales classiquement utilisées en épidémiologie comprennent les données de mortalité et les données de morbidité parmi lesquelles on retrouve les registres de population et les données médico-administratives. Les registres de population apportent une information de qualité mais elle est souvent limitée à une population restreinte. Pour estimer l’incidence d’un cancer sur une population plus importante, il faut alors utiliser des données de mortalité, qui sont souvent incomplètes (cancer de bon pronostic, cancer non enregistré comme cause de décès).Après avoir fait le point sur le recueil des données médico-administratives, créées pour le financement à l’activité des établissements de soins, les avantages et les limites de leur utilisation en épidémiologie sont évoqués au niveau international.Résultats : Les bases de données médico-administratives sont une source de données standardisées de niveau national disponibles dans de nombreux pays. Leur utilisation pour la facturation favorise leur qualité et leur exhaustivité. Les patients atteints de cancers étant souvent hospitalisés, ils sont bien représentés dans ces bases. Nous avons identifié quelques limites à l’utilisation de ces bases de données. La plupart peuvent être corrigées ou contrôlées avec le chaînage entre les données médico-administratives et les données de registres. Il est également possible de corriger les estimations issues des bases médico-administratives en extrapolant les données de registres avec un modèle statistique.Conclusion : Si l’intérêt des bases de données médico-administratives est bien démontré, il est indispensable de maintenir le recueil des données de registre pour permettre une validation de ces données, que ce soit par des techniques de chaînage ou de modélisation.Intervenant : ABBAS Rachid (CHRU, Service de Bio statistique et d’Informatique Médicale, Dijon, France).Conférence enregistrée lors des journées EMOIS 2011 à Nancy. Session : PMSI et épidémiologie II. Modérateurs Eliane ALBUISSON (CHU de Nancy) et Gilles CHATELIER (Association Robert Debré – Paris).Réalisation, production : Canalu U/3S, CERIMES.SCD Médecine. Mot(s) clés libre(s) : bases de données médico-administratives, cancers, chaînage, données de registre, EMOIS Nancy 2011, épidémiologie, modélisation, PMSI
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